| 順位 | チーム | 勝点 | 試合 | 勝 | 引分 | 敗 | 得失差 | 得点 | 失点 |
| 1 | ジュビロ磐田 | 12 | 6 | 3 | 3 | 0 | 7 | 9 | 2 |
| 2 | 柏レイソル | 7 | 6 | 1 | 4 | 1 | 0 | 2 | 2 |
| 3 | ベガルタ仙台 | 6 | 6 | 1 | 3 | 2 | -4 | 4 | 8 |
| 4 | コンサドーレ札幌 | 5 | 6 | 1 | 2 | 3 | -3 | 3 | 6 |
| 順位 | チーム | 勝点 | 試合 | 勝 | 引分 | 敗 | 得失差 | 得点 | 失点 |
| 1 | ＦＣ東京 | 13 | 6 | 4 | 1 | 1 | 5 | 8 | 3 |
| 2 | 清水エスパルス | 12 | 6 | 4 | 0 | 2 | 1 | 9 | 8 |
| 3 | 東京ヴェルディ1969 | 7 | 6 | 2 | 1 | 3 | 0 | 10 | 10 |
| 4 | ヴィッセル神戸 | 2 | 6 | 0 | 2 | 4 | -6 | 5 | 11 |
| 順位 | チーム | 勝点 | 試合 | 勝 | 引分 | 敗 | 得失差 | 得点 | 失点 |
| 1 | ジェフユナイテッド市原 | 11 | 6 | 3 | 2 | 1 | 4 | 14 | 10 |
| 2 | ガンバ大阪 | 8 | 6 | 2 | 2 | 2 | 0 | 12 | 12 |
| 3 | 横浜Ｆ・マリノス | 7 | 6 | 2 | 1 | 3 | -3 | 5 | 8 |
| 4 | 京都パープルサンガ | 6 | 6 | 1 | 3 | 2 | -1 | 7 | 8 |
| 順位 | チーム | 勝点 | 試合 | 勝 | 引分 | 敗 | 得失差 | 得点 | 失点 |
| 1 | 浦和レッズ | 13 | 6 | 4 | 1 | 1 | 2 | 12 | 10 |
| 2 | 鹿島アントラーズ | 9 | 6 | 3 | 0 | 3 | -1 | 9 | 10 |
| 3 | 名古屋グランパスエイト | 7 | 6 | 2 | 1 | 3 | 2 | 11 | 9 |
| 4 | サンフレッチェ広島 | 5 | 6 | 1 | 2 | 3 | -3 | 4 | 7 |
| ＜試合方式および勝敗の決定> 90分間（前後半各45分）の試合を行い、勝敗が決しない場合は引き分けとする。 ＜勝 点＞ |
| 第1節 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 04/27(土) | Ａグループ | 14:00 | 磐田 | 5 | - | 1 | 仙台 | 鴨池 |
| Ａグループ | 15:00 | 柏 | 1 | - | 0 | 札幌 | 柏の葉 | |
| Ｂグループ | 13:00 | Ｆ東京 | 3 | - | 0 | 清水 | 駒沢 | |
| Ｂグループ | 15:00 | 神戸 | 1 | - | 1 | 東京Ｖ | 神戸ウイ | |
| Ｃグループ | 15:00 | 市原 | 2 | - | 0 | 横浜FM | 市原 | |
| Ｃグループ | 15:00 | Ｇ大阪 | 2 | - | 2 | 京都 | 万博 | |
| Ｄグループ | 14:00 | 名古屋 | 0 | - | 2 | 浦和 | 瑞穂陸 | |
| Ｄグループ | 15:00 | 鹿島 | 1 | - | 0 | 広島 | ひたちな | |
| 第2節 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 04/30(火) | Ａグループ | 19:00 | 札幌 | 0 | - | 0 | 磐田 | 札幌厚別 |
| Ａグループ | 19:00 | 仙台 | 1 | - | 1 | 柏 | 仙台 | |
| Ｂグループ | 19:00 | 東京Ｖ | 0 | - | 1 | Ｆ東京 | 東京 | |
| Ｂグループ | 19:00 | 清水 | 2 | - | 1 | 神戸 | 草薙陸 | |
| Ｃグループ | 19:00 | 京都 | 1 | - | 1 | 市原 | 西京極 | |
| Ｃグループ | 19:00 | Ｇ大阪 | 0 | - | 1 | 横浜FM | 万博 | |
| Ｄグループ | 19:00 | 浦和 | 3 | - | 2 | 鹿島 | 駒場 | |
| Ｄグループ | 19:00 | 広島 | 1 | - | 1 | 名古屋 | 広島ス | |
| 第3節 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 05/03(金・祝) | Ａグループ | 13:00 | 仙台 | 1 | - | 0 | 札幌 | 仙台 |
| Ａグループ | 14:00 | 磐田 | 0 | - | 0 | 柏 | 磐田 | |
| Ｂグループ | 15:00 | 東京Ｖ | 2 | - | 0 | 清水 | 東京 | |
| Ｂグループ | 15:00 | 神戸 | 0 | - | 0 | Ｆ東京 | 神戸ユ | |
| Ｃグループ | 15:00 | 市原 | 4 | - | 4 | Ｇ大阪 | 市原 | |
| Ｃグループ | 15:00 | 横浜FM | 0 | - | 0 | 京都 | 横浜国 | |
| Ｄグループ | 15:00 | 鹿島 | 3 | - | 1 | 名古屋 | ひたちな | |
| Ｄグループ | 15:00 | 広島 | 0 | - | 0 | 浦和 | 広島ビ | |
| 第4節 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 05/06(月・祝) | Ａグループ | 13:00 | 札幌 | 1 | - | 1 | 仙台 | 函館 |
| Ａグループ | 15:00 | 柏 | 0 | - | 0 | 磐田 | 柏の葉 | |
| Ｂグループ | 15:00 | Ｆ東京 | 1 | - | 0 | 神戸 | 東京 | |
| Ｂグループ | 15:00 | 清水 | 3 | - | 1 | 東京Ｖ | 草薙陸 | |
| Ｃグループ | 15:00 | 京都 | 2 | - | 1 | 横浜FM | 西京極 | |
| Ｃグループ | 15:00 | Ｇ大阪 | 3 | - | 2 | 市原 | 万博 | |
| Ｄグループ | 14:00 | 名古屋 | 3 | - | 0 | 鹿島 | 瑞穂陸 | |
| Ｄグループ | 15:00 | 浦和 | 3 | - | 1 | 広島 | 駒場 | |
| 第5節 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 05/09(木) | Ａグループ | 19:00 | 柏 | 0 | - | 0 | 仙台 | 柏の葉 |
| Ａグループ | 19:00 | 磐田 | 3 | - | 1 | 札幌 | 磐田 | |
| Ｂグループ | 19:00 | Ｆ東京 | 2 | - | 1 | 東京Ｖ | 国立 | |
| Ｂグループ | 19:00 | 神戸 | 0 | - | 2 | 清水 | 神戸ユ | |
| Ｃグループ | 19:00 | 市原 | 2 | - | 1 | 京都 | 市原 | |
| Ｃグループ | 19:00 | 横浜FM | 2 | - | 1 | Ｇ大阪 | 横浜国 | |
| Ｄグループ | 19:00 | 鹿島 | 2 | - | 3 | 浦和 | 笠松 | |
| Ｄグループ | 19:00 | 名古屋 | 1 | - | 2 | 広島 | 瑞穂陸 | |
| 第6節 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 05/12(日) | Ａグループ | 13:00 | 札幌 | 1 | - | 0 | 柏 | 室蘭 |
| Ａグループ | 13:00 | 仙台 | 0 | - | 1 | 磐田 | 仙台 | |
| Ｂグループ | 13:00 | 東京Ｖ | 5 | - | 3 | 神戸 | 青森 | |
| Ｂグループ | 13:00 | 清水 | 2 | - | 1 | Ｆ東京 | 日本平 | |
| Ｃグループ | 14:00 | 横浜FM | 1 | - | 3 | 市原 | 三ツ沢 | |
| Ｃグループ | 14:00 | 京都 | 1 | - | 2 | Ｇ大阪 | 西京極 | |
| Ｄグループ | 14:00 | 浦和 | 1 | - | 5 | 名古屋 | 駒場 | |
| Ｄグループ | 14:00 | 広島 | 0 | - | 1 | 鹿島 | 広島ビ | |
| 準々決勝 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 9月4日（水） | 19:00 | 浦和 | 1 | - | 0 | 柏 | 駒場 | |
| 19:00 | 市原 | 0 | - | 3 | 清水 | 市原 | ||
| 19:00 | Ｆ東京 | 1 | - | 3 | Ｇ大阪 | 東京 | ||
| 19:00 | 磐田 | 1 | - | 2 | 鹿島 | 磐田 | ||
| 準決勝 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 10月2日（水） | 19:00 | 鹿島 | 2v | - | 1 | 清水 | 鹿島 | |
| 19:00 | Ｇ大阪 | 2 | - | 3v | 浦和 | 万博 | ||
| 決勝 | 開催日時 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 11月4日（月） | 14：00 | 鹿島 | 1 | - | 0 | 浦和 | 国立 | |