| 出場チーム Ｊ1-18チーム、Ｊ2-18チーム、JFL前期上位4チーム（SAGAWA SHIGA FC、ガイナーレ鳥取、横河 武蔵野FC、ジェフリザーブズ）、大学1チーム（第33回総理大臣杯全日本大学サッカートーナメント優勝チーム）、都道府県代表47チーム 日 程
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| 2回戦 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 10/11 | 13:00 | 鹿 島 | 1 | - | 0 | アルテ高崎 | カシマ |
| 10/11 | 13:00 | 愛 媛 | 2 | 2 PK 4 | 2 | 福 岡 | ニンスタ |
| 10/11 | 13:00 | 神 戸 | 5 | - | 0 | 東海大学 | ホムスタ |
| 10/11 | 13:00 | 柏 | 0 | 4 PK 2 | 0 | ジェフリザーブズ | 柏の葉 |
| 10/11 | 13:00 | 広 島 | 5 | - | 0 | JAPANサッカーカレッジ | コカ広島ス |
| 10/10 | 13:00 | 鳥 栖 | 5 | - | 0 | 佐賀東高校 | 佐賀陸 |
| 10/11 | 13:00 | G大阪 | 5 | - | 2 | 流通経済大学 | 万 博 |
| 10/10 | 15:00 | 水 戸 | 2 | - | 3 | 福岡大学 | ひたちなか |
| 10/11 | 13:00 | Ｖ・ファーレン長崎 | 0 | - | 4 | 横浜M | 長崎県 |
| 10/11 | 13:00 | C大阪 | 1 | - | 2 | 福島ユナイテッドFC | 長 居 |
| 10/11 | 13:00 | 川 崎 | 6 | - | 1 | レノファ山口 | 等々力 |
| 10/11 | 13:00 | 富 山 | 0 | 4 PK 1 | 0 | 岡 山 | 富 山 |
| 10/11 | 15:00 | Ｆ東京 | 4 | - | 0 | カマタマーレ讃岐 | 味スタ |
| 10/10 | 13:00 | 草 津 | 3 | - | 1 | ＳＡＧＡＷＡ ＳＨＩＧＡ ＦＣ | 群馬サ |
| 10/11 | 13:00 | ソニー仙台FC | 2 | - | 4 | 大 宮 | 秋田陸 |
| 10/10 | 13:00 | 仙 台 | 1 | - | 0 | ツエーゲン金 沢 | ユアスタ |
| 10/11 | 13:00 | 松本山雅FC | 2 | - | 0 | 浦 和 | 松本球 |
| 10/11 | 13:00 | 岐 阜 | 1 | - | 0 | 栃 木 | 長良川 |
| 10/11 | 13:00 | 大 分 | 3 | 4 PK 3 | 3 | 横河武蔵野FC | 大分陸 |
| 10/12 | 13:00 | 千 葉 | 3 | - | 0 | Honda FC | フクアリ |
| 10/10 | 13:00 | 名古屋 | 4 | - | 0 | 沖縄かりゆしFC | 刈 谷 |
| 10/11 | 13:00 | 東京V | 0 | - | 1 | ホンダロック | 西が丘 |
| 10/11 | 13:00 | 磐 田 | 2 | - | 0 | 高知大学 | ヤマハ |
| 10/11 | 13:00 | 徳 島 | 1 | - | 3 | 鹿屋体育大学 | 徳 島球 |
| 10/11 | 13:00 | 山 形 | 2 | - | 0 | 日本文理大学 | NDスタ |
| 10/10 | 15:00 | 湘 南 | 0 | - | 1 | 明治大学 | 平 塚 |
| 10/11 | 13:00 | 奈良クラブ | 0 | - | 3 | 新 潟 | 福井テクノ |
| 10/11 | 19:00 | 熊 本 | 2 | 2 PK 4 | 2 | 横浜Ｃ | 熊 本 |
| 10/11 | 13:00 | 清 水 | 2 | - | 0 | 佐川印刷SC | アウスタ |
| 10/11 | 13:00 | 札 幌 | 2 | - | 1 | ガイナーレ鳥取 | 札幌厚別 |
| 10/10 | 13:00 | 京 都. | 4 | - | 0 | ヴェルフェたかはら那須 | 西京極 |
| 10/11 | 13:00 | 甲 府 | 3 | 4 PK 3 | 3 | 関西大学 | 小 瀬 |
| 3回戦 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 10/31 | 13:00 | 鹿 島 | 3 | - | 0 | 福 岡 | カシマ |
| 13:00 | 神 戸 | 1 | - | 0 | 柏 | ホムスタ | |
| 15:00 | 広 島 | 2 | - | 3 | 鳥 栖 | コカ広島ス | |
| 13:00 | Ｇ大阪 | 6 | - | 1 | 福岡大学 | 万 博 | |
| 11/01 | 15:00 | 横浜Ｍ | 4 | - | 1 | 福島ユナイテッドFC | 日産ス |
| 11/11 | 19:00 | 川 崎 | 3 | - | 1 | 富 山 | 等々力 |
| 19:00 | Ｆ東京 | 3 | - | 2 | 草 津 | 長崎県 | |
| 10/31 | 15:00 | 大 宮 | 1 | - | 2 | 仙 台 | NACK |
| 13:00 | 松本山雅FC | 1 | - | 4 | 岐 阜 | 秋田陸 | |
| 11/01 | 13:00 | 大 分 | 2 | - | 3 | 千 葉 | 九石ド |
| 15:00 | 名古屋 | 2 | - | 0 | ホンダロック | 瑞穂陸 | |
| 10/31 | 13:00 | 磐 田 | 3 | - | 1 | 鹿屋体育大学 | ヤマハ |
| 13:00 | 山 形 | 0 | - | 3 | 明治大学 | NDスタ | |
| 15:00 | 新 潟 | 3 | - | 1 | 横浜Ｃ | 東北電ス | |
| 13:00 | 清 水 | 2 | - | 0 | 札 幌 | アウスタ | |
| 13:00 | 京 都 | 1 | - | 2 | 甲 府 | 西京極 | |
| 4回戦 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 11/14 | 15:00 | 鹿 島 | 2 | - | 1 | 神 戸 | カシマ |
| 13:00 | 鳥 栖 | 1 | - | 3 | Ｇ大阪 | 広島ビ | |
| 11/15 | 15:00 | 横浜Ｍ | 1 | - | 2 | 川 崎 | 日産ス |
| 13:00 | Ｆ東京 | 0 | - | 3 | 仙 台 | 丸 亀 | |
| 13:00 | 岐 阜 | 1 | - | 0 | 千 葉 | 熊谷陸 | |
| 15:00 | 名古屋 | 3 | - | 1 | 磐 田 | 瑞穂陸 | |
| 13:00 | 明治大学 | 1 | - | 3 | 新 潟 | NDスタ | |
| 11/14 | 13:00 | 清 水 | 3 | - | 0 | 甲 府 | とりスタ |
| 準々決勝 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 12/12 | 15:00 | 鹿 島 | 1 | - | 2 | Ｇ大阪 | カシマ |
| 13:00 | 仙 台 | 2 | - | 1 | 川 崎 | ユアスタ | |
| 15:00 | 名古屋 | 3 | - | 0 | 岐 阜 | 瑞穂陸 | |
| 13:00 | 清 水 | 3 | - | 2 | 新 潟 | アウスタ | |
| 準決勝 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 12/29 | 15:00 | Ｇ大阪 | 2 | - | 1 | 仙 台 | 国 立 |
| 13:00 | 名古屋 | 1 | 5PK3 | 1 | 清 水 | エコパ | |
| 決勝 | ホーム | アウェイ | 競技場 | ||||
| 1/1 | 14:00 | Ｇ大阪 | 4 | - | 1 | 名古屋 | 国 立 |
| データ |
| 2008天皇杯結果 |
| 2007天皇杯結果 |
| 2006天皇杯結果 |
| 2005天皇杯結果 |
| 2004天皇杯結果 |
| 各種データ |
| 出場停止 |
| ケガ人・代表情報 |